Ban Quản lý Di sản thiên nhiên Quần đảo Cát Bà được thành lập ngày 06/09/2013 trực thuộc Ủy ban nhân dân thành phố Hải Phòng trên cơ sở thống nhất quản lý của: Ban Quản lý Khu dự trữ sinh quyển quần đảo Cát Bà, Vườn Quốc gia Cát Bà, và Ban Quản lý các Vịnh thuộc quần đảo Cát Bà. Ban Quản lý Di sản thiên nhiên Quần đảo Cát Bà là cơ quan đầu mối, phối hợp và xây dựng hồ sơ đề cử Di sản thiên nhiên Quần đảo Cát Bà.